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黔北麻羊TYR基因多態性及生物信息學分析

作者: 翁吉梅 羅錚 徐偉 封竣琪 黃蘭 蔡惠芬 羅衛星

關鍵詞: 黔北麻羊 TYR基因 SNPs 生物信息學

摘要:為研究黔北麻羊毛色形成的遺傳機製,本實驗對黔北麻羊哺乳動物酪氨酸酶(TYR)基因外顯子區域運用混合DNA池結合PCR產物直接測序方法進行多態性分析,在TYR基因外顯子區域共篩選出5個SNPs,分別為Exon1-G617A、Exon1-G685T、Exon3-C 1236T (Asn-Lys)、Exon5-C1578T (Gly-Glu)、Exon5-T1862C;進而利用生物信息學分析軟件對PCR擴增所獲序列進行mRNA二級結構及蛋白質二級結構和三級結構分析,發現Exon3-C 1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T (Gly-Glu)引起mRNA二級結構的改變,其中Exon 1-G685T、Exon3-C1236T (Asn-Lys)、Exon5-T1862C突變導致其mRNA二級結構最小自由能增大,即二級結構穩定性降低,其錯義突變位點Exon3-C 1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T (Gly-Glu)均引起蛋白質二級結構和三級結構的改變.


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